心肌囊肿是心脏较常见的一种良性肿瘤，大部分情况下无症状，通常是在检查时发现。但囊肿过大可能压迫心脏影响健康，因此还是需要及时治疗。在诊断时应与下列疾病鉴别：

1、淋巴管瘤

纵隔囊性淋巴管瘤是一种少见的纵隔良性肿瘤，占纵隔肿瘤和囊肿总数的3.85%，其形成可能与淋巴管、体静脉吻合异常导致淋巴回流受阻有关，也可来源于颈部淋巴管原基，于心肌下降时被带入胸内，故可见于纵隔各处。

多位于前纵隔中上部，肿块大小不一，可单房或多房或呈蜂窝状，分为颈-纵隔型、腋-纵隔型、纵隔型及颈-腋-纵隔型4种类型。

2、食道囊肿

位于后纵隔前部，食道旁圆形或椭圆形囊性肿块，轮廓光滑，囊壁较厚>4mm，呈肌性软组织，局部食道可压，CT值为50Hu左右。

3、皮样囊肿

大多位于前中纵隔，块影轮廓清，边缘锐利，但密度往言行不一不均匀，CT值为-10～10Hu，有1/3到半数可见钙化，与支气管相通可形成液气腔，如咳出毛发等，有助于鉴别。

4、支气管囊肿

好发于支气管和支气管周围，圆形或椭圆形，水样密度均匀影，边缘光滑锐利，与支气管相通进可随呼吸大小改变。如含有部分液体时，形成气液囊肿。CT表现密度均匀，囊壁薄，内缘光整，可造成邻近气管或支气管受压变窄，CT值为30～50Hu。

5、心肌脂肪垫

常见于肥胖者，以左心膈角较多，没有完整轮廓，密度相对较心肌囊肿更低，侧位片往往显示不清，CT值呈现负值(-50Hu以下)。MRI对区分脂肪或水样物质很敏感，在SE序列TI-WI图象上脂肪垫表现为高信号。